Villa Clara entstand im Jahr 1960, als Doro und Lucia Bonora beschlossen, in Torbole eine kleine Pension mit Restaurant und fünf Zimmern zu errichten.
Lucia kannte die Gastronomie bereits gut, während Doro als Maurer und Inhaber eines kleinen Bauunternehmens seine Arbeit und Erfahrung in das Projekt einbrachte. Gemeinsam gründeten sie die Pensione Clara, benannt nach ihrer erstgeborenen Tochter.
Der Tourismus am Gardasee steckte damals noch in den Anfängen, und die ersten Gäste kamen vor allem aus Deutschland. Die Pension wuchs rasch: Bereits 1961 stieg die Zahl der Zimmer von fünf auf dreißig, und das Restaurant wurde erweitert. Es war ganzjährig und auch für externe Gäste geöffnet und entwickelte sich zu einem Treffpunkt für Urlauber, Einwohner von Torbole und Durchreisende.
Anfang der Achtzigerjahre wurde das Restaurant geschlossen, und aus der Pensione Clara wurde nach und nach das Hotel Villa Clara. Seitdem hat sich das Haus immer wieder verändert und an die neuen Anforderungen des Tourismus angepasst.
1992 übernahmen die Geschwister Clara, Rosy und Claudio die Leitung. Ende der Neunzigerjahre kam auch Lorenza zum Familienbetrieb hinzu.
Auch nach mehr als 60 Jahren bewahrt Villa Clara die Freude an der Gastfreundschaft, die Verbundenheit mit der Region und die Erinnerung an all die Menschen, die im Laufe der Zeit durch seine Tür gegangen sind.